在进行内部存货交易的存货跌价准备的抵销时，需要遵循以下步骤：
1. 确定存货跌价准备的金额：首先，需要计算出存货的实际成本与可变现净值之间的差额，即存货跌价准备的金额。
2. 分析内部交易对存货的影响：如果内部交易涉及的是存货，那么需要分析该交易对存货成本和可变现净值的影响。例如，如果内部交易导致存货成本增加，那么存货跌价准备的金额也应相应调整。
3. 抵销存货跌价准备：在编制合并财务报表时，需要将母公司对子公司投资所形成的商誉和子公司对母公司的少数股权进行抵销。其中，存货跌价准备的抵销通常是在合并资产负债表中进行的。在合并资产负债表中，存货项目需要按照其成本与可变现净值孰低计量，如果子公司个别财务报表中已经计提了存货跌价准备，那么在合并报表中需要将这一准备金额予以抵销。
4. 编制抵销分录：在合并财务报表中，存货跌价准备的抵销可以通过编制抵销分录来实现。通常，这个分录会涉及以下科目：
   - 存货——子公司（成本）
   - 存货跌价准备——子公司
   - 少数股东权益（如果子公司有少数股东）
   - 商誉（如果存在商誉）

例如，如果子公司个别财务报表中计提了100万元的存货跌价准备，而合并报表中存货的成本与可变现净值相等，不需要计提存货跌价准备，那么在合并报表中需要抵销这一准备金额。抵销分录如下：

借：存货——子公司 100万元
   贷：存货跌价准备——子公司 100万元

如果存货的成本与可变现净值之间存在差额，则需要根据实际情况调整存货跌价准备的金额，并在合并报表中进行相应的抵销。