预算单位零余额账户是指在预算编制过程中，将预算数额和实际支出数额相等的账户。它的作用主要有以下几点：
1. 控制预算支出。预算单位在编制预算时，按照预算数额设立零余额账户，实际支出时，必须从该账户中划拨资金，确保支出不超过预算数额。
2. 提高预算执行效率。零余额账户的使用可以提高预算执行效率，减少预算执行中的错误和漏洞，保证预算执行的准确性和及时性。
3. 优化预算管理。零余额账户的使用可以帮助预算单位优化预算管理，提高预算编制和执行的质量，促进预算管理的科学化和规范化。
4. 加强内部控制。零余额账户的使用可以加强预算单位的内部控制，防范和化解财务风险，确保财务安全和稳定。