发现问题后，审计整改程序通常包含以下几个关键步骤：

第一步是问题确认与分析。审计人员在发现问题后，需要与被审计单位进行沟通，共同确认问题的真实性和准确性。详细分析问题产生的原因、背景以及可能带来的影响。这一步骤至关重要，因为只有准确把握问题的本质，才能制定出有效的整改措施。例如，如果发现财务报表中存在数据错误，需要分析是人为操作失误、系统故障还是内部控制漏洞导致的。

第二步是制定整改方案。根据问题分析的结果，被审计单位应制定具体的整改方案。整改方案要明确整改目标、整改措施、责任人和整改期限。整改措施应具有针对性和可操作性，能够切实解决发现的问题。比如，针对内部控制漏洞，可能需要完善相关制度、加强人员培训等。同时，要将整改责任落实到具体的部门和个人，确保整改工作有人抓、有人管。

第三步是实施整改。被审计单位按照整改方案积极组织实施整改工作。在整改过程中，要定期对整改情况进行检查和评估，及时发现整改过程中出现的新问题，并对整改方案进行调整和完善。例如，在完善内部控制制度的过程中，可能会发现某些制度在实际执行中存在困难，需要对制度进行进一步优化。

第四步是整改报告与审核。整改工作完成后，被审计单位要向审计部门提交整改报告，详细说明整改情况和结果。审计部门对整改报告进行审核，通过查阅资料、实地检查等方式，验证整改是否到位。如果发现整改不彻底或存在虚假整改的情况，要责令被审计单位重新整改。

第五步是后续跟踪与监督。审计部门要对整改情况进行后续跟踪和监督，确保问题得到彻底解决，防止问题反弹。可以定期对被审计单位进行回访，检查相关问题是否再次出现。同时，将审计整改情况纳入被审计单位的绩效考核体系，提高被审计单位对整改工作的重视程度。

通过以上完整的整改程序，能够确保审计发现的问题得到有效解决，提高被审计单位的管理水平和运营效率，充分发挥审计的监督和服务作用。