在函证审计中，审计人员向相关方发送函证函函证函，要求相关方提供特定的信息或确认某些事实。这些函证函的回复对审计的完成和结论具有重要意义，因此需要对相关方的回复进行核实的原因包括：
1. 证明真实性：通过核实相关方的回复，审计人员可以验证相关方提供的信息的真实性和准确性，确保审计工作的可靠性和准确性。
2. 发现潜在问题：通过核实相关方的回复，审计人员可以发现潜在的问题或矛盾之处，帮助审计人员更好地了解被审计实体的情况，及时发现可能存在的风险或问题。
3. 辅助证据收集：相关方的回复可以作为审计的一个重要证据来源，有助于审计人员获取更多的证据来支持审计结论。
4. 保持独立性：通过核实相关方的回复，审计人员可以保持独立性和客观性，不仅依赖于相关方提供的信息，还可以从其他渠道获取信息，确保审计工作的独立性和公正性。

因此，对相关方的回复进行核实是函证审计中的重要步骤，有助于提高审计工作的质量和有效性。